12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1854 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1854  hypothetical protein  100 
 
 		 62 aa  130  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12532  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1027  hypothetical protein  65.38 
 
 		 72 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2688  hypothetical protein  65.38 
 
 		 59 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0965838  normal  0.349266 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0201  hypothetical protein  69.23 
 
 		 59 aa  77  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.836121 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1680  hypothetical protein  61.54 
 
 		 60 aa  71.6  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2761  hypothetical protein  59.62 
 
 		 60 aa  68.2  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2912  hypothetical protein  55.77 
 
 		 62 aa  67.8  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.572302 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1922  hypothetical protein  53.33 
 
 		 68 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2318  hypothetical protein  50.85 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.272642  normal  0.993319 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4186  hypothetical protein  50 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0412  hypothetical protein  54.55 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0068  hypothetical protein  47.06 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.471063 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>