16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1027 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1027  hypothetical protein  100 
 
 		 72 aa  152  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2688  hypothetical protein  100 
 
 		 59 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0965838  normal  0.349266 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0201  hypothetical protein  88.14 
 
 		 59 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.836121 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1680  hypothetical protein  65.52 
 
 		 60 aa  92.4  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2761  hypothetical protein  69.09 
 
 		 60 aa  90.1  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2912  hypothetical protein  67.27 
 
 		 62 aa  87.8  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.572302 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1854  hypothetical protein  65.38 
 
 		 62 aa  79  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12532  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4186  hypothetical protein  43.04 
 
 		 97 aa  67.4  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2318  hypothetical protein  57.69 
 
 		 89 aa  64.3  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.272642  normal  0.993319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1922  hypothetical protein  55.17 
 
 		 68 aa  62  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0412  hypothetical protein  55.56 
 
 		 66 aa  61.6  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0068  hypothetical protein  50 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.471063 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2845  hypothetical protein  42.03 
 
 		 78 aa  54.3  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1505  hypothetical protein  53.33 
 
 		 75 aa  46.2  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08049  Lactobacillus shifted protein [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AUI1]  47.37 
 
 		 213 aa  44.7  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01400  conserved hypothetical protein  46.34 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>