14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2912 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2912  hypothetical protein  100 
 
 		 62 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.572302 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2761  hypothetical protein  71.19 
 
 		 60 aa  101  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1027  hypothetical protein  67.27 
 
 		 72 aa  87.8  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2688  hypothetical protein  67.27 
 
 		 59 aa  87.8  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0965838  normal  0.349266 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0201  hypothetical protein  65.45 
 
 		 59 aa  87  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.836121 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1680  hypothetical protein  63.64 
 
 		 60 aa  81.3  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1854  hypothetical protein  55.77 
 
 		 62 aa  67.8  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12532  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0068  hypothetical protein  54.9 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.471063 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4186  hypothetical protein  52.83 
 
 		 97 aa  61.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0412  hypothetical protein  52.83 
 
 		 66 aa  56.6  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2318  hypothetical protein  49.09 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.272642  normal  0.993319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1922  hypothetical protein  44.64 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2845  hypothetical protein  51.11 
 
 		 78 aa  50.4  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1505  hypothetical protein  53.66 
 
 		 75 aa  47.4  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>