14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4548 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4548  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  427  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0503956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5145  hypothetical protein  54.98 
 
 		 211 aa  216  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.578028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23650  hypothetical protein  48.57 
 
 		 211 aa  198  6e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0078  putative transcriptional regulator  49.29 
 
 		 214 aa  186  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0461  putative transcriptional regulator  52.68 
 
 		 207 aa  179  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2430  hypothetical protein  50.5 
 
 		 210 aa  149  4e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2435  hypothetical protein  35.84 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2569  hypothetical protein  35.15 
 
 		 211 aa  101  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000211673  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4100  hypothetical protein  30.05 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2358  hypothetical protein  38.18 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000689108  normal  0.0155249 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6227  hypothetical protein  33.33 
 
 		 726 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.432833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11149  hypothetical protein  27.5 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3441  hypothetical protein  31.93 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0535  hypothetical protein  25.5 
 
 		 190 aa  62  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215554 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>