14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_23650 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_23650  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  424  1e-118  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5145  hypothetical protein  59.05 
 
 
211 aa  242  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.578028  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0078  putative transcriptional regulator  57.14 
 
 
214 aa  221  4e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0461  putative transcriptional regulator  55.61 
 
 
207 aa  200  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4548  hypothetical protein  48.57 
 
 
214 aa  198  6e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0503956 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2430  hypothetical protein  58.29 
 
 
210 aa  186  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2435  hypothetical protein  38.33 
 
 
218 aa  117  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2569  hypothetical protein  34.27 
 
 
211 aa  106  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000211673  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11149  hypothetical protein  34 
 
 
201 aa  103  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4100  hypothetical protein  33.01 
 
 
201 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6227  hypothetical protein  37.88 
 
 
726 aa  85.5  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.432833  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2358  hypothetical protein  36.8 
 
 
205 aa  84  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000689108  normal  0.0155249 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0535  hypothetical protein  29 
 
 
190 aa  80.1  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215554 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3441  hypothetical protein  27.86 
 
 
206 aa  67.8  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>