14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0078 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0078  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 214 aa  415  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5145  hypothetical protein  69.19 
 
 		 211 aa  283  9e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.578028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23650  hypothetical protein  57.14 
 
 		 211 aa  233  2.0000000000000002e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0461  putative transcriptional regulator  63.55 
 
 		 207 aa  210  1e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4548  hypothetical protein  49.29 
 
 		 214 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0503956 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2430  hypothetical protein  63.18 
 
 		 210 aa  196  2.0000000000000003e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2435  hypothetical protein  42.36 
 
 		 218 aa  136  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2569  hypothetical protein  38.03 
 
 		 211 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000211673  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11149  hypothetical protein  33.99 
 
 		 201 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6227  hypothetical protein  38.98 
 
 		 726 aa  84.7  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.432833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4100  hypothetical protein  31.07 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2358  hypothetical protein  39.17 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000689108  normal  0.0155249 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0535  hypothetical protein  28.57 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215554 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3441  hypothetical protein  28.97 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>