16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6227 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6227  hypothetical protein  100 
 
 		 726 aa  1496    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.432833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11149  hypothetical protein  36.41 
 
 		 201 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2358  hypothetical protein  39.52 
 
 		 205 aa  102  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000689108  normal  0.0155249 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4100  hypothetical protein  33.67 
 
 		 201 aa  101  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0535  hypothetical protein  31.34 
 
 		 190 aa  95.5  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215554 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2569  hypothetical protein  32.49 
 
 		 211 aa  91.3  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000211673  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3440  hypothetical protein  23.62 
 
 		 469 aa  85.9  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23650  hypothetical protein  37.88 
 
 		 211 aa  85.5  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0078  putative transcriptional regulator  38.98 
 
 		 214 aa  84.7  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3441  hypothetical protein  27.36 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4548  hypothetical protein  33.33 
 
 		 214 aa  78.6  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0503956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5145  hypothetical protein  36.21 
 
 		 211 aa  74.7  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.578028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2359  hypothetical protein  24.86 
 
 		 478 aa  74.7  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000357176  hitchhiker  0.00887894 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0461  putative transcriptional regulator  35.29 
 
 		 207 aa  68.6  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2430  hypothetical protein  35.96 
 
 		 210 aa  63.5  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0532  hypothetical protein  22.61 
 
 		 415 aa  55.1  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318863 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>