16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2547 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2547  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  284  2.9999999999999996e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0775927  decreased coverage  0.00000269458 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2398  hypothetical protein  78.17 
 
 		 177 aa  228  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.796069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12649  hypothetical protein  52.48 
 
 		 179 aa  143  9e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0834  hypothetical protein  44.76 
 
 		 153 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.727995  normal  0.702383 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2028  protein of unknown function DUF101  44.93 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00595059  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0423  hypothetical protein  33.9 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1251  archease family protein  25.52 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1831  hypothetical protein  25.9 
 
 		 150 aa  50.8  0.000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000057693  normal  0.0919322 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1729  hypothetical protein  32.87 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1793  hypothetical protein  31.39 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.694231 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0479  hypothetical protein  37.35 
 
 		 138 aa  47  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.541748  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0569  hypothetical protein  24.83 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0707  hypothetical protein  23.74 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1747  protein of unknown function DUF101  21.01 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0121  hypothetical protein  26.44 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000001565  hitchhiker  0.0000415863 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1680  hypothetical protein  30.28 
 
 		 143 aa  40  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>