12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0279 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0279  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  681    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.739829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0008  hypothetical protein  40.3 
 
 		 327 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3073  hypothetical protein  40.26 
 
 		 334 aa  242  7e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2089  hypothetical protein  35.52 
 
 		 334 aa  195  9e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.164933 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0937  hypothetical protein  26.2 
 
 		 333 aa  94.7  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000101235 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0753  hypothetical protein  25.81 
 
 		 333 aa  87  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2745  hypothetical protein  25.54 
 
 		 327 aa  82.4  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.379235  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4268  hypothetical protein  27.04 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0374  hypothetical protein  23.49 
 
 		 330 aa  69.3  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0573  hypothetical protein  28.51 
 
 		 329 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3930  hypothetical protein  27.97 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2862  hypothetical protein  26.16 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.190658  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>