12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0008 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0008  hypothetical protein  100 
 
 
327 aa  648    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3073  hypothetical protein  51.83 
 
 
334 aa  323  3e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0279  hypothetical protein  40.3 
 
 
338 aa  250  3e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.739829  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2089  hypothetical protein  32.15 
 
 
334 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.164933 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2745  hypothetical protein  29.94 
 
 
327 aa  93.2  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.379235  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4268  hypothetical protein  32.51 
 
 
318 aa  88.6  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0753  hypothetical protein  26.23 
 
 
333 aa  84.3  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0937  hypothetical protein  25.47 
 
 
333 aa  67.8  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000101235 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0374  hypothetical protein  25 
 
 
330 aa  66.6  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04291  hypothetical protein  23.05 
 
 
324 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2862  hypothetical protein  25.95 
 
 
334 aa  63.9  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.190658  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0573  hypothetical protein  30.04 
 
 
329 aa  57  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>