12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2089 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2089  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  670    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.164933 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0279  hypothetical protein  35.52 
 
 		 338 aa  195  9e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.739829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3073  hypothetical protein  33.94 
 
 		 334 aa  164  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0008  hypothetical protein  32.15 
 
 		 327 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2745  hypothetical protein  27 
 
 		 327 aa  86.3  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.379235  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0937  hypothetical protein  25.32 
 
 		 333 aa  75.1  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000101235 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4268  hypothetical protein  29.9 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0374  hypothetical protein  25.76 
 
 		 330 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0753  hypothetical protein  32.02 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2862  hypothetical protein  26.7 
 
 		 334 aa  47.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.190658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0573  hypothetical protein  29.69 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3930  hypothetical protein  32.76 
 
 		 323 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>