13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1674 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1674  Cbb3-type cytochrome oxidase component  100 
 
 		 52 aa  105  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0361  cytochrome c oxidase, cbb3-type, CcoQ subunit  49.02 
 
 		 52 aa  60.5  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0377  cytochrome c oxidase, Cbb3-type, CcoQ subunit  49.02 
 
 		 52 aa  60.5  0.000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2576  Cbb3-type cytochrome oxidase component  56.25 
 
 		 56 aa  59.3  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.973883  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0467  Cbb3-type cytochrome oxidase component  50.98 
 
 		 52 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0000540469  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2094  cytochrome c oxidase FixQ chain  51.06 
 
 		 65 aa  53.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.064575  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4960  Cbb3-type cytochrome oxidase component  45.83 
 
 		 50 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.779194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5933  Cbb3-type cytochrome oxidase component  50 
 
 		 50 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.404492  normal  0.435436 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6266  Cbb3-type cytochrome oxidase component  50 
 
 		 50 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.496314  normal  0.190729 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5017  Cbb3-type cytochrome oxidase component  47.92 
 
 		 50 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0536  Cbb3-type cytochrome oxidase component  45.83 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.150564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0694  Cbb3-type cytochrome c oxidase CcoQ subunit  43.48 
 
 		 67 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2349  Cbb3-type cytochrome oxidase component  43.48 
 
 		 67 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.337464  normal  0.494297 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>