12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_R0006 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_R0006  tRNA-Gln  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0046  tRNA-Gln  96.43 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0289454  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0043  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0016  tRNA-Gln  96.3 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160581  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0061  tRNA-Gln  96.3 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0203947  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0012  tRNA-Gln  96.3 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.376695  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0036  tRNA-Gln  96.3 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0023  tRNA-Gln  96.3 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00187779  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0011  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.253488 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0002  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0035  tRNA-Gln  86 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.446482  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0035  tRNA-Pro  96.15 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0637572  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>