12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1703 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1703  6-carboxyhexanoate--CoA ligase  100 
 
 
245 aa  494  1e-139  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0813  6-carboxyhexanoate--CoA ligase  42.02 
 
 
240 aa  187  9e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.233748  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1420  6-carboxyhexanoate--CoA ligase  42.86 
 
 
236 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1666  6-carboxyhexanoate--CoA ligase  34.92 
 
 
265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000144885  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1095  6-carboxyhexanoate--CoA ligase  40.33 
 
 
244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.102724  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0001  6-carboxyhexanoate--CoA ligase  40.33 
 
 
244 aa  139  3e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0887  6-carboxyhexanoate--CoA ligase  37.75 
 
 
245 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0822  6-carboxyhexanoate--CoA ligase  39.53 
 
 
244 aa  128  9.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0762721  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0424  6-carboxyhexanoate--CoA ligase  31.43 
 
 
235 aa  109  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2449  6-carboxyhexanoate--CoA ligase  30.08 
 
 
230 aa  89  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2497  6-carboxyhexanoate--CoA ligase  30.08 
 
 
230 aa  89  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2393  6-carboxyhexanoate--CoA ligase  28.15 
 
 
228 aa  79  0.00000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>