12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2393 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2393  6-carboxyhexanoate--CoA ligase  100 
 
 		 228 aa  471  1e-132  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2449  6-carboxyhexanoate--CoA ligase  57.08 
 
 		 230 aa  280  1e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2497  6-carboxyhexanoate--CoA ligase  57.08 
 
 		 230 aa  280  1e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1420  6-carboxyhexanoate--CoA ligase  39.41 
 
 		 236 aa  122  6e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0424  6-carboxyhexanoate--CoA ligase  32.07 
 
 		 235 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0001  6-carboxyhexanoate--CoA ligase  38.31 
 
 		 244 aa  115  6e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1095  6-carboxyhexanoate--CoA ligase  37.5 
 
 		 244 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.102724  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0887  6-carboxyhexanoate--CoA ligase  32.65 
 
 		 245 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1666  6-carboxyhexanoate--CoA ligase  31.12 
 
 		 265 aa  107  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000144885  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0822  6-carboxyhexanoate--CoA ligase  37.05 
 
 		 244 aa  105  4e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0762721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0813  6-carboxyhexanoate--CoA ligase  30.26 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.233748  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1703  6-carboxyhexanoate--CoA ligase  28.15 
 
 		 245 aa  79  0.00000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>