12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0813 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0813  6-carboxyhexanoate--CoA ligase  100 
 
 
240 aa  488  1e-137  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.233748  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1703  6-carboxyhexanoate--CoA ligase  42.02 
 
 
245 aa  187  9e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1420  6-carboxyhexanoate--CoA ligase  37.45 
 
 
236 aa  138  7e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1666  6-carboxyhexanoate--CoA ligase  33.6 
 
 
265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000144885  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1095  6-carboxyhexanoate--CoA ligase  36.65 
 
 
244 aa  129  3e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.102724  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0887  6-carboxyhexanoate--CoA ligase  32.68 
 
 
245 aa  128  6e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0001  6-carboxyhexanoate--CoA ligase  36.25 
 
 
244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0822  6-carboxyhexanoate--CoA ligase  35.46 
 
 
244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0762721  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0424  6-carboxyhexanoate--CoA ligase  26.53 
 
 
235 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2449  6-carboxyhexanoate--CoA ligase  29.52 
 
 
230 aa  90.1  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2497  6-carboxyhexanoate--CoA ligase  29.52 
 
 
230 aa  90.1  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2393  6-carboxyhexanoate--CoA ligase  30.26 
 
 
228 aa  84.7  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>