53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1959 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1959  hypothetical protein  100 
 
 
79 aa  142  1e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.352409  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1629  transglycosylase-associated protein  65.33 
 
 
83 aa  97.4  6e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0033  hypothetical protein  67.57 
 
 
88 aa  94.7  4e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0866  hypothetical protein  60.76 
 
 
82 aa  94  6e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2149  hypothetical protein  74.68 
 
 
80 aa  93.2  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.673997  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0861  hypothetical protein  67.95 
 
 
81 aa  85.5  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0056  hypothetical protein  63.29 
 
 
85 aa  85.5  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1354  hypothetical protein  58.23 
 
 
87 aa  80.5  0.000000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.972774  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0055  hypothetical protein  51.9 
 
 
79 aa  74.7  0.0000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0899  transglycosylase-associated protein  53.62 
 
 
83 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1141  hypothetical protein  69.62 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00570897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1155  hypothetical protein  53.62 
 
 
83 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0892  hypothetical protein  53.62 
 
 
83 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0988  hypothetical protein  53.62 
 
 
83 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1028  hypothetical protein  53.62 
 
 
83 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0909  hypothetical protein  53.62 
 
 
83 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000195971  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4274  hypothetical protein  53.62 
 
 
83 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.126831  hitchhiker  0.00313613 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1064  hypothetical protein  53.62 
 
 
83 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6423e-37 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0924  hypothetical protein  53.62 
 
 
83 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1082  hypothetical protein  53.62 
 
 
83 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1140  hypothetical protein  72.73 
 
 
82 aa  70.9  0.000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00407686  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0097  hypothetical protein  48.1 
 
 
76 aa  67.4  0.00000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.126932  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3381  hypothetical protein  52.86 
 
 
82 aa  67  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.470225  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1676  Transglycosylase-associated protein  45.21 
 
 
84 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1980  transglycosylase-associated protein  48 
 
 
82 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2694  transglycosylase-associated protein  47.95 
 
 
80 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.975215  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0069  hypothetical protein  76.19 
 
 
84 aa  65.1  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1035  hypothetical protein  65 
 
 
82 aa  64.7  0.0000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.242749  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3356  hypothetical protein  48.61 
 
 
82 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3381  hypothetical protein  48.61 
 
 
82 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3056  hypothetical protein  48.61 
 
 
82 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000292001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3411  hypothetical protein  48.61 
 
 
82 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.627369  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3162  hypothetical protein  48.61 
 
 
82 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00262305  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3146  hypothetical protein  48.61 
 
 
82 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177868  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3382  hypothetical protein  48.61 
 
 
82 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0674128  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1870  hypothetical protein  48.61 
 
 
82 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0423  hypothetical protein  47.89 
 
 
83 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.407263  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0433  hypothetical protein  47.89 
 
 
83 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.515021  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3084  transglycosylase-associated protein  45.45 
 
 
82 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00138083  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2342  hypothetical protein  50.67 
 
 
80 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.327817  hitchhiker  0.00107333 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2903  hypothetical protein  50.67 
 
 
80 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.675499  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2890  hypothetical protein  48 
 
 
80 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0011999 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2692  hypothetical protein  48 
 
 
80 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00157734  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2926  hypothetical protein  48 
 
 
80 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000491326  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2938  hypothetical protein  48 
 
 
80 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000113891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2618  hypothetical protein  48 
 
 
80 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.434987  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2887  hypothetical protein  48 
 
 
80 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.471323  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1716  Transglycosylase-associated protein  42.86 
 
 
84 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2641  hypothetical protein  46.67 
 
 
89 aa  47  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.271706  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1804  Transglycosylase-associated protein  39.51 
 
 
91 aa  46.2  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0431301  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0470  transglycosylase-associated protein  35.53 
 
 
90 aa  43.5  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3969  Transglycosylase-associated protein  35.44 
 
 
83 aa  41.2  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3681  transglycosylase-associated protein  40.54 
 
 
80 aa  41.6  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>