11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4263 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4263  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  486  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1417  hypothetical protein  66.81 
 
 		 237 aa  327  9e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.112985  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0558  hypothetical protein  59.65 
 
 		 232 aa  215  5.9999999999999996e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0683271  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2468  hypothetical protein  42.54 
 
 		 241 aa  203  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552125  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0377  hypothetical protein  37.28 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0690  RlfA  36.36 
 
 		 241 aa  139  3e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2019  hypothetical protein  30.83 
 
 		 232 aa  90.1  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191226 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1161  hypothetical protein  28.76 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3067  hypothetical protein  28.39 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2008  hypothetical protein  30.37 
 
 		 266 aa  52.8  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4035  hypothetical protein  24.88 
 
 		 279 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000073087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>