11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2988 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2988  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  350  4e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2620  hypothetical protein  91.67 
 
 		 192 aa  300  7.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0679  hypothetical protein  39.6 
 
 		 166 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1668  gp65  31.62 
 
 		 159 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000431261  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1027  gp65  31.62 
 
 		 159 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.47636  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3852  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.753191  hitchhiker  0.0000000217039 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1675  hypothetical protein  28.78 
 
 		 167 aa  48.1  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1404  hypothetical protein  28.26 
 
 		 150 aa  45.4  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000291349  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2499  conserved hypothetical protein  30 
 
 		 185 aa  43.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0434882  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0245  hypothetical protein  30 
 
 		 185 aa  43.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.396678  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4445  hypothetical protein  30 
 
 		 183 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00706423  unclonable  0.00000000112107 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>