10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1675 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1675  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  342  2e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130919  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3420  hypothetical protein  32.17 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00999602  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2988  hypothetical protein  28.78 
 
 		 169 aa  48.1  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1164  hypothetical protein  29.79 
 
 		 171 aa  48.1  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2620  hypothetical protein  28.78 
 
 		 192 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1882  hypothetical protein  29.71 
 
 		 194 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000478426  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1668  gp65  27.33 
 
 		 159 aa  44.7  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000431261  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1027  gp65  27.33 
 
 		 159 aa  44.7  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.47636  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3852  hypothetical protein  25.78 
 
 		 148 aa  44.3  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.753191  hitchhiker  0.0000000217039 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0679  hypothetical protein  26.05 
 
 		 166 aa  43.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>