16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1027 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1668  gp65  100 
 
 
159 aa  325  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000431261  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1027  gp65  100 
 
 
159 aa  325  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.47636  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3852  hypothetical protein  62.33 
 
 
148 aa  201  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.753191  hitchhiker  0.0000000217039 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2620  hypothetical protein  32.61 
 
 
192 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1610  hypothetical protein  33.33 
 
 
158 aa  73.6  0.0000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.305831 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2988  hypothetical protein  31.62 
 
 
169 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4692  hypothetical protein  44.44 
 
 
178 aa  67.4  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0679  hypothetical protein  28.95 
 
 
166 aa  60.8  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0667  putative bacteriophage protein (Gp55-like)  34.29 
 
 
142 aa  57  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.631141  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2618  hypothetical protein  24.59 
 
 
156 aa  53.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0365925 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3981  hypothetical protein  22.38 
 
 
170 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000690616  normal  0.122233 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3420  hypothetical protein  27.01 
 
 
199 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00999602  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1404  hypothetical protein  29.29 
 
 
150 aa  47  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000291349  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1675  hypothetical protein  27.33 
 
 
167 aa  44.7  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130919  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1756  transcriptional regulator CII, putative  41.51 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.812409  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2262  hypothetical protein  24.81 
 
 
176 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.416085  normal  0.844705 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>