17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2401 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP2401  serine protease  100 
 
 
244 aa  504  9.999999999999999e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0527  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25 
 
 
235 aa  55.5  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.265786 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1861  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30 
 
 
239 aa  53.1  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1896  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30 
 
 
239 aa  53.1  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3040  2-alkenal reductase  27.57 
 
 
375 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0397571 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0552  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.37 
 
 
423 aa  47.4  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6645  HtrA2 peptidase  25 
 
 
469 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00239269 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  26.35 
 
 
501 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  25.75 
 
 
500 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0793  2-alkenal reductase  27.67 
 
 
376 aa  43.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.323454 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0620  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.75 
 
 
674 aa  43.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1897  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.45 
 
 
239 aa  42.7  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1862  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.45 
 
 
239 aa  42.7  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2202  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25 
 
 
497 aa  42.4  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.718376  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1619  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.86 
 
 
242 aa  42.7  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.527174 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  25.58 
 
 
383 aa  42.4  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2947  2-alkenal reductase  28.03 
 
 
374 aa  42  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>