14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0311 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0311  glycogen debranching protein  100 
 
 		 869 aa  1753    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6094  Glycogen debranching protein-like protein  26.73 
 
 		 815 aa  252  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.709243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1790  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.36 
 
 		 676 aa  111  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378432 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2170  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.72 
 
 		 676 aa  107  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000556903  unclonable  0.00000000115329 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3259  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.01 
 
 		 735 aa  60.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574596  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1764  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.14 
 
 		 868 aa  54.3  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0548176  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0376  glycogen debranching protein  22.42 
 
 		 834 aa  53.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.603461 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0912  Amylo-alpha-16-glucosidase  25 
 
 		 746 aa  53.5  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1771  amylo-alpha-1,6-glucosidase family  23.53 
 
 		 758 aa  48.9  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0110772  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1366  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  27.37 
 
 		 720 aa  47  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.711936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.25 
 
 		 700 aa  46.6  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0259  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.65 
 
 		 719 aa  45.1  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0139  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.42 
 
 		 733 aa  44.7  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0822  hypothetical protein  23.4 
 
 		 675 aa  44.3  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0538951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>