13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1212 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2553  hypothetical protein  99.21 
 
 		 378 aa  746    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1212  hypothetical protein  100 
 
 		 392 aa  781    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0328457 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1969  hypothetical protein  77.78 
 
 		 378 aa  555  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.256858  normal  0.306966 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4551  hypothetical protein  37.26 
 
 		 376 aa  145  8.000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.339359 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0087  hypothetical protein  34.15 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113697  unclonable  0.0000108237 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1587  hypothetical protein  30 
 
 		 355 aa  49.7  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.748272  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2654  hypothetical protein  26.77 
 
 		 380 aa  48.9  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.113589  normal  0.0183141 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3358  hypothetical protein  25.84 
 
 		 390 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.342415 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1589  hypothetical protein  24.22 
 
 		 397 aa  47.8  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1153  hypothetical protein  28.57 
 
 		 396 aa  47.8  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4333  hypothetical protein  32.61 
 
 		 434 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.989415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0310  hypothetical protein  36.79 
 
 		 314 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2954  hypothetical protein  27.7 
 
 		 301 aa  42.7  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>