32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3790 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3765  hypothetical protein  97.06 
 
 		 492 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1413  integrase catalytic subunit  97.06 
 
 		 399 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3471  hypothetical protein  97.06 
 
 		 338 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.139394 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3790  hypothetical protein  100 
 
 		 34 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2130  integrase catalytic subunit  97.06 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.590347 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1799  hypothetical protein  97.06 
 
 		 81 aa  71.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0728  hypothetical protein  93.94 
 
 		 92 aa  68.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0657  transposase IS3/IS911 family protein  87.88 
 
 		 362 aa  65.1  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2735  transposase IS3/IS911 family protein  87.88 
 
 		 362 aa  65.1  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2711  transposase IS3/IS911 family protein  87.88 
 
 		 362 aa  65.1  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155615  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2874  hypothetical protein  79.41 
 
 		 71 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3364  ISxcd1 transposase  79.41 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0618  ISxcd1 transposase  79.41 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2897  ISxcd1 transposase  76.47 
 
 		 209 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3442  integrase catalytic subunit  61.76 
 
 		 266 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.702285 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4025  integrase catalytic subunit  64.71 
 
 		 266 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1620  ISMca4, transposase, OrfAB  58.82 
 
 		 362 aa  49.7  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0823  ISMca4, transposase, OrfAB  58.82 
 
 		 362 aa  50.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.586582  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2689  prophage LambdaMc01, ISMca4, transposase, OrfAB  58.82 
 
 		 362 aa  49.7  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0539833  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3960  integrase catalytic subunit  61.76 
 
 		 275 aa  48.9  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2857  integrase catalytic subunit  61.76 
 
 		 275 aa  48.9  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000284719  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3451  integrase catalytic subunit  61.76 
 
 		 248 aa  48.5  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4044  IS3 family transposase orfB  62.07 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1778  transposase OrfB  58.82 
 
 		 288 aa  47  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0849  transposase OrfB  58.82 
 
 		 249 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.553346 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0640  transposase OrfB  58.82 
 
 		 249 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.263209 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0637  transposase OrfB  58.82 
 
 		 249 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.417638 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3953  integrase catalytic subunit  63.64 
 
 		 265 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0400  integrase catalytic subunit  63.64 
 
 		 265 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4053  integrase catalytic subunit  63.64 
 
 		 265 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02900  ISMca4, transposase, OrfAB  65.62 
 
 		 41 aa  43.9  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0345642  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3763  ISxcd1 transposase  61.76 
 
 		 52 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>