18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_5029 on replicon NC_010683
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012851  Rpic12D_5435  putative component of type II secretion apparatus  97.85 
 
 		 419 aa  764    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5029  hypothetical protein  100 
 
 		 418 aa  839    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5200  putative type IV pilus biosynthesis protein  39.57 
 
 		 417 aa  286  4e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1535  hypothetical protein  39.57 
 
 		 417 aa  286  4e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.197533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5910  PilO; putative type IV pilus biosynthesis protein  27.63 
 
 		 421 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.938925  normal  0.0381503 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5879  pilO; putative type IV pilus biosynthesis protein  24.07 
 
 		 438 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.87974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5662  PilO; putative type IV pilus biosynthesis protein  24.56 
 
 		 438 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125237  normal  0.028275 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0770  pilO family protein  24.43 
 
 		 429 aa  48.9  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.15746  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3733  pilin accessory protein PilO  24.39 
 
 		 445 aa  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59270  type IV b pilus protein  26.87 
 
 		 441 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00533868  hitchhiker  0.00000189781 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4472  type IV b pilus protein  26.12 
 
 		 441 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5450  hypothetical protein  25.43 
 
 		 429 aa  45.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.752604  normal  0.0236455 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0659  putative PilO  27.77 
 
 		 432 aa  43.9  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.591304  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1609  putative PilO  27.77 
 
 		 432 aa  43.9  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.289822  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2172  putative type IV pilus biogenesis protein  27.77 
 
 		 432 aa  43.9  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273576  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2256  putative type IV pilus biogenesis protein  27.77 
 
 		 432 aa  43.9  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1980  putative PilO  27.77 
 
 		 432 aa  43.9  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.778405  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0656  putative type IV pilus biosynthesis protein  27.77 
 
 		 432 aa  43.9  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>