33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0151 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0151  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  177  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.715591 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0158  hypothetical protein  98.82 
 
 		 85 aa  176  9e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0297  hypothetical protein  92.94 
 
 		 85 aa  166  9e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0116  hypothetical protein  77.65 
 
 		 85 aa  142  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0085  hypothetical protein  76.47 
 
 		 85 aa  142  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.618842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0597  hypothetical protein  69.77 
 
 		 147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124441  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0415  hypothetical protein  69.77 
 
 		 85 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3217  hypothetical protein  69.77 
 
 		 85 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0435  hypothetical protein  69.77 
 
 		 85 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.970375  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1346  hypothetical protein  69.77 
 
 		 85 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0905241  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0248  hypothetical protein  69.77 
 
 		 85 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.377134  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0359  hypothetical protein  68.6 
 
 		 85 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0389  hypothetical protein  64.71 
 
 		 85 aa  121  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.865039  hitchhiker  0.00751382 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2915  hypothetical protein  63.53 
 
 		 85 aa  120  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.164845  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2964  hypothetical protein  63.53 
 
 		 85 aa  120  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6258  hypothetical protein  63.53 
 
 		 85 aa  120  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.556682 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2301  hypothetical protein  63.53 
 
 		 85 aa  120  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2930  hypothetical protein  63.53 
 
 		 85 aa  120  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2827  hypothetical protein  63.53 
 
 		 85 aa  120  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.813761  normal  0.405339 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0192  hypothetical protein  62.35 
 
 		 85 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0478  hypothetical protein  58.82 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.133469 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4239  hypothetical protein  58.82 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.341066 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3630  hypothetical protein  43.48 
 
 		 92 aa  84  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.226472 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3266  hypothetical protein  45.45 
 
 		 98 aa  82  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103272 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0300  hypothetical protein  33.33 
 
 		 93 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0739  hypothetical protein  35.79 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0443  hypothetical protein  30.11 
 
 		 93 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.833917  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1123  hypothetical protein  34.02 
 
 		 97 aa  57  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0437  hypothetical protein  32.29 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0698447  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0446  hypothetical protein  32.29 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4785  hypothetical protein  32.61 
 
 		 92 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153664  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0611  hypothetical protein  29.13 
 
 		 103 aa  51.2  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0989  hypothetical protein  30.3 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>