33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3630 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3630  hypothetical protein  100 
 
 
92 aa  186  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.226472 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3266  hypothetical protein  53.06 
 
 
98 aa  99.4  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103272 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0359  hypothetical protein  47.83 
 
 
85 aa  89.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0478  hypothetical protein  46.74 
 
 
85 aa  89.4  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.133469 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4239  hypothetical protein  46.74 
 
 
85 aa  89.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.341066 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0597  hypothetical protein  46.74 
 
 
147 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124441  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0248  hypothetical protein  46.74 
 
 
85 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.377134  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1346  hypothetical protein  46.74 
 
 
85 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0905241  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3217  hypothetical protein  46.74 
 
 
85 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0435  hypothetical protein  46.74 
 
 
85 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.970375  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0415  hypothetical protein  46.74 
 
 
85 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0192  hypothetical protein  44.57 
 
 
85 aa  87.8  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0297  hypothetical protein  44.57 
 
 
85 aa  85.9  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0085  hypothetical protein  43.48 
 
 
85 aa  84.7  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.618842  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0151  hypothetical protein  43.48 
 
 
85 aa  84  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.715591 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0116  hypothetical protein  44.57 
 
 
85 aa  83.6  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0158  hypothetical protein  43.48 
 
 
85 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2915  hypothetical protein  45.65 
 
 
85 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.164845  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2930  hypothetical protein  45.65 
 
 
85 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.881109  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2964  hypothetical protein  45.65 
 
 
85 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2827  hypothetical protein  45.65 
 
 
85 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.813761  normal  0.405339 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2301  hypothetical protein  45.65 
 
 
85 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6258  hypothetical protein  45.65 
 
 
85 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.556682 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0389  hypothetical protein  44.57 
 
 
85 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.865039  hitchhiker  0.00751382 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0443  hypothetical protein  41.94 
 
 
93 aa  77.4  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.833917  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0739  hypothetical protein  40 
 
 
95 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0446  hypothetical protein  38.14 
 
 
96 aa  73.6  0.0000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0300  hypothetical protein  39.78 
 
 
93 aa  73.6  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0437  hypothetical protein  38.14 
 
 
96 aa  73.6  0.0000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0698447  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1123  hypothetical protein  39.8 
 
 
97 aa  72  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0611  hypothetical protein  35.92 
 
 
103 aa  72.4  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0989  hypothetical protein  37.37 
 
 
99 aa  70.1  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4785  hypothetical protein  38.71 
 
 
92 aa  69.7  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>