33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0443 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0443  hypothetical protein  100 
 
 
93 aa  195  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.833917  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0300  hypothetical protein  89.25 
 
 
93 aa  177  4e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0437  hypothetical protein  70.83 
 
 
96 aa  142  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0698447  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0446  hypothetical protein  70.83 
 
 
96 aa  142  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0739  hypothetical protein  69.47 
 
 
95 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4785  hypothetical protein  69.15 
 
 
92 aa  133  9e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153664  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0611  hypothetical protein  58.25 
 
 
103 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0989  hypothetical protein  60.78 
 
 
99 aa  123  7e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1123  hypothetical protein  58.76 
 
 
97 aa  115  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3630  hypothetical protein  41.94 
 
 
92 aa  77.4  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.226472 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3266  hypothetical protein  39.8 
 
 
98 aa  74.7  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103272 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0158  hypothetical protein  31.18 
 
 
85 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0085  hypothetical protein  30.11 
 
 
85 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.618842  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0151  hypothetical protein  30.11 
 
 
85 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.715591 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0116  hypothetical protein  32.26 
 
 
85 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0192  hypothetical protein  31.18 
 
 
85 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0389  hypothetical protein  31.18 
 
 
85 aa  57  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.865039  hitchhiker  0.00751382 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4239  hypothetical protein  30.11 
 
 
85 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.341066 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0478  hypothetical protein  30.11 
 
 
85 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.133469 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2915  hypothetical protein  30.11 
 
 
85 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.164845  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0597  hypothetical protein  30.11 
 
 
147 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124441  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2827  hypothetical protein  30.11 
 
 
85 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.813761  normal  0.405339 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6258  hypothetical protein  30.11 
 
 
85 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.556682 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2930  hypothetical protein  30.11 
 
 
85 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.881109  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3217  hypothetical protein  30.11 
 
 
85 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0435  hypothetical protein  30.11 
 
 
85 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.970375  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0415  hypothetical protein  30.11 
 
 
85 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1346  hypothetical protein  30.11 
 
 
85 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0905241  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0248  hypothetical protein  30.11 
 
 
85 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.377134  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2301  hypothetical protein  30.11 
 
 
85 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2964  hypothetical protein  30.11 
 
 
85 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0297  hypothetical protein  30.11 
 
 
85 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0359  hypothetical protein  29.03 
 
 
85 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>