15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4685 on replicon NC_012855
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012855  Rpic12D_4685  transposase IS3/IS911  100 
 
 		 120 aa  248  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.137823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7673  methyl-accepting chemotaxis protein  50 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.259212  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4354  transposase IS3/IS911  36.28 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0856  transposase IS3/IS911  33.33 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2991  transposase IS3/IS911 family protein  32.56 
 
 		 99 aa  44.3  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2803  transposase IS3/IS911  32.56 
 
 		 99 aa  43.5  0.0009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.227333  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5937  transposase IS3/IS911  32.95 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.653759  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0678  transposase IS3/IS911 family protein  31.4 
 
 		 374 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.505807  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3049  transposase IS3/IS911 family protein  31.4 
 
 		 374 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3237  hypothetical protein  31.4 
 
 		 374 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0336824  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3275  transcriptional regulator, GntR family  31.4 
 
 		 374 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000360291  normal  0.033149 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3374  hypothetical protein  31.4 
 
 		 374 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3411  hypothetical protein  31.4 
 
 		 374 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.042682  normal  0.457317 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3515  hypothetical protein  31.4 
 
 		 374 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1144  transposase IS3/IS911 family protein  28.41 
 
 		 98 aa  40.8  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>