179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2212 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2212  protein of unknown function DUF55  100 
 
 		 178 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.84327 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2670  protein of unknown function DUF55  96.79 
 
 		 156 aa  320  6e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0856709  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2403  hypothetical protein  85.35 
 
 		 168 aa  286  9e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0651  hypothetical protein  83.44 
 
 		 167 aa  269  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2792  hypothetical protein  78.29 
 
 		 159 aa  250  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.495937 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1847  hypothetical protein  75 
 
 		 153 aa  241  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2458  hypothetical protein  75 
 
 		 153 aa  241  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2463  hypothetical protein  75 
 
 		 153 aa  241  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.563467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0836  hypothetical protein  68.82 
 
 		 194 aa  241  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2375  hypothetical protein  75 
 
 		 153 aa  239  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2507  hypothetical protein  75 
 
 		 153 aa  239  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5789  hypothetical protein  74.34 
 
 		 153 aa  237  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.407242 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1032  hypothetical protein  74.34 
 
 		 153 aa  236  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558922  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1025  hypothetical protein  74.34 
 
 		 153 aa  234  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000631398  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2330  hypothetical protein  73.03 
 
 		 153 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0213902  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2956  hypothetical protein  73.03 
 
 		 153 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.235784  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1642  hypothetical protein  73.03 
 
 		 153 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1184  hypothetical protein  68.45 
 
 		 170 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.162922  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0831  hypothetical protein  67.86 
 
 		 170 aa  231  5e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0992  protein of unknown function DUF55  71.33 
 
 		 152 aa  226  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.18186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2217  hypothetical protein  71.05 
 
 		 156 aa  224  7e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4934  protein of unknown function DUF55  67.33 
 
 		 153 aa  210  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.455283  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2669  hypothetical protein  66.23 
 
 		 157 aa  205  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2092  hypothetical protein  64.97 
 
 		 159 aa  206  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.598256  normal  0.211749 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1663  protein of unknown function DUF55  64.97 
 
 		 159 aa  205  3e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2927  hypothetical protein  64.67 
 
 		 154 aa  205  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2834  hypothetical protein  63.4 
 
 		 171 aa  203  9e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4026  hypothetical protein  61.74 
 
 		 153 aa  199  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0614  hypothetical protein  54.9 
 
 		 154 aa  187  5e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.78998  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6859  protein of unknown function DUF55  58.78 
 
 		 156 aa  183  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0506026 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0126  hypothetical protein  57.33 
 
 		 152 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3282  protein of unknown function DUF55  58.82 
 
 		 159 aa  181  4.0000000000000006e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0784521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2674  hypothetical protein  57.33 
 
 		 151 aa  181  6e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02383  hypothetical protein  60.13 
 
 		 156 aa  180  9.000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3972  hypothetical protein  53.9 
 
 		 162 aa  177  5.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.766671  normal  0.0536087 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0961  hypothetical protein  56.76 
 
 		 155 aa  177  7e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.23359  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3630  hypothetical protein  66.94 
 
 		 124 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1969  hypothetical protein  55.78 
 
 		 153 aa  175  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0843  hypothetical protein  54.73 
 
 		 155 aa  175  3e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2609  hypothetical protein  57.14 
 
 		 153 aa  173  9e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2287  hypothetical protein  55.48 
 
 		 153 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000164575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2359  hypothetical protein  55.48 
 
 		 153 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000352986  normal  0.137051 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0353  hypothetical protein  54.36 
 
 		 152 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2723  hypothetical protein  56.46 
 
 		 153 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.218147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2477  hypothetical protein  55.48 
 
 		 153 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0301106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1737  protein of unknown function DUF55  56.46 
 
 		 153 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000864721 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2648  hypothetical protein  56.46 
 
 		 153 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00302  hypothetical protein  53.74 
 
 		 156 aa  171  3.9999999999999995e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1677  hypothetical protein  55.78 
 
 		 153 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1853  protein of unknown function DUF55  54.86 
 
 		 150 aa  166  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.890211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2196  hypothetical protein  54.86 
 
 		 150 aa  166  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3514  hypothetical protein  54.11 
 
 		 153 aa  166  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768926  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0697  protein of unknown function DUF55  53.38 
 
 		 155 aa  165  4e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2907  hypothetical protein  51.66 
 
 		 152 aa  164  8e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2770  protein of unknown function DUF55  53.47 
 
 		 152 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0051852  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0509  hypothetical protein  53.06 
 
 		 152 aa  163  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000393887  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1642  hypothetical protein  53.06 
 
 		 152 aa  162  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  7.18563e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0319  hypothetical protein  54.17 
 
 		 149 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1521  hypothetical protein  55.07 
 
 		 152 aa  160  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0365947  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2537  hypothetical protein  50.96 
 
 		 158 aa  160  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.954602  normal  0.0651387 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0037  hypothetical protein  51.39 
 
 		 157 aa  159  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01784  hypothetical protein  50 
 
 		 182 aa  159  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.280348  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5972  hypothetical protein  54.86 
 
 		 152 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1573  hypothetical protein  50.34 
 
 		 156 aa  159  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000165437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69050  hypothetical protein  53.47 
 
 		 152 aa  157  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5440  hypothetical protein  51.06 
 
 		 149 aa  156  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1357  hypothetical protein  53.02 
 
 		 155 aa  155  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000263938  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0315  hypothetical protein  52.08 
 
 		 149 aa  155  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16301  hypothetical protein  53.62 
 
 		 152 aa  154  6e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5031  hypothetical protein  51.39 
 
 		 150 aa  154  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5229  hypothetical protein  51.39 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0781  protein of unknown function DUF55  48 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0209669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16181  hypothetical protein  50.34 
 
 		 152 aa  152  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5205  hypothetical protein  50 
 
 		 149 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3142  hypothetical protein  49.66 
 
 		 152 aa  151  5e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2149  hypothetical protein  48.61 
 
 		 149 aa  150  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1312  hypothetical protein  51.7 
 
 		 165 aa  149  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.29751e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3129  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  51.02 
 
 		 150 aa  149  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16061  hypothetical protein  49.66 
 
 		 155 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5266  hypothetical protein  50 
 
 		 153 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.561565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0266  protein of unknown function DUF55  45.4 
 
 		 173 aa  148  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.252089  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2323  hypothetical protein  47.95 
 
 		 155 aa  147  5e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.300007  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2135  protein of unknown function DUF55  53.47 
 
 		 151 aa  147  8e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.204502 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5113  hypothetical protein  51.02 
 
 		 149 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.839421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3975  protein of unknown function DUF55  49.32 
 
 		 154 aa  145  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.644317  normal  0.0207421 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1180  hypothetical protein  51.72 
 
 		 154 aa  145  3e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05161  hypothetical protein  52.45 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1030  protein of unknown function DUF55  50 
 
 		 160 aa  144  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2948  hypothetical protein  52.17 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0251  protein of unknown function DUF55  48.3 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2275  hypothetical protein  47.62 
 
 		 163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0523  hypothetical protein  49.29 
 
 		 156 aa  138  3e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2363  hypothetical protein  46.26 
 
 		 158 aa  138  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2026  hypothetical protein  49.31 
 
 		 189 aa  137  7e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.661768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2154  hypothetical protein  52.63 
 
 		 148 aa  137  8.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.694914  normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3203  protein of unknown function DUF55  48.37 
 
 		 153 aa  137  8.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4260  protein of unknown function DUF55  46.72 
 
 		 149 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4320  protein of unknown function DUF55  46.72 
 
 		 149 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000124301  hitchhiker  0.00573912 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3446  hypothetical protein  47.95 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0271189  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15461  hypothetical protein  46.72 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.439189  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>