16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4594 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_4594  hypothetical protein  100 
 
 
396 aa  818    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2945  hypothetical protein  34.72 
 
 
325 aa  152  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2037  hypothetical protein  34.07 
 
 
306 aa  149  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2063  hypothetical protein  34.07 
 
 
306 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0144  hypothetical protein  35.39 
 
 
288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12781  hypothetical protein  34.63 
 
 
326 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.3952  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1382  hypothetical protein  37.56 
 
 
272 aa  117  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.616319  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3162  hypothetical protein  38.54 
 
 
302 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0469333  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2934  hypothetical protein  35.71 
 
 
302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2627  hypothetical protein  38.07 
 
 
310 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3952  hypothetical protein  40.12 
 
 
283 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0808936  normal  0.0841425 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2907  hypothetical protein  38.51 
 
 
309 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1016  hypothetical protein  33.66 
 
 
339 aa  96.3  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358771 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3616  hypothetical protein  36.63 
 
 
291 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.524336  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1313  hypothetical protein  31.28 
 
 
289 aa  92  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000615424 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3758  hypothetical protein  33.9 
 
 
323 aa  90.9  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>