16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3758 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3758  hypothetical protein  100 
 
 
323 aa  669    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1313  hypothetical protein  61.73 
 
 
289 aa  362  7.0000000000000005e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000615424 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2627  hypothetical protein  60.68 
 
 
310 aa  360  2e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1382  hypothetical protein  47.06 
 
 
272 aa  262  6e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.616319  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3162  hypothetical protein  45.52 
 
 
302 aa  258  8e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0469333  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2934  hypothetical protein  45.17 
 
 
302 aa  256  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1016  hypothetical protein  48.51 
 
 
339 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358771 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2907  hypothetical protein  45.8 
 
 
309 aa  210  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3952  hypothetical protein  35.29 
 
 
283 aa  140  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0808936  normal  0.0841425 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3616  hypothetical protein  36.22 
 
 
291 aa  138  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.524336  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0144  hypothetical protein  34.86 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2945  hypothetical protein  29.41 
 
 
325 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2037  hypothetical protein  28.85 
 
 
306 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4594  hypothetical protein  33.9 
 
 
396 aa  90.5  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2063  hypothetical protein  28.57 
 
 
306 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12781  hypothetical protein  33.33 
 
 
326 aa  89.7  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.3952  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>