16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1382 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1382  hypothetical protein  100 
 
 
272 aa  563  1e-160  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.616319  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2934  hypothetical protein  54.68 
 
 
302 aa  301  9e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3162  hypothetical protein  54.68 
 
 
302 aa  300  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0469333  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1016  hypothetical protein  49.63 
 
 
339 aa  268  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358771 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3758  hypothetical protein  47.06 
 
 
323 aa  262  4e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2627  hypothetical protein  45.05 
 
 
310 aa  243  3e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1313  hypothetical protein  43.64 
 
 
289 aa  227  2e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000615424 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2907  hypothetical protein  42.59 
 
 
309 aa  224  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0144  hypothetical protein  42.68 
 
 
288 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3952  hypothetical protein  33.81 
 
 
283 aa  125  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0808936  normal  0.0841425 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2037  hypothetical protein  32.53 
 
 
306 aa  118  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3616  hypothetical protein  38.79 
 
 
291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.524336  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2063  hypothetical protein  32.14 
 
 
306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4594  hypothetical protein  37.26 
 
 
396 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12781  hypothetical protein  35.71 
 
 
326 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.3952  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2945  hypothetical protein  27.62 
 
 
325 aa  98.6  9e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>