13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4496 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0126  hypothetical protein  92.1 
 
 		 1165 bp  1580    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0372  hypothetical protein  93.22 
 
 		 1165 bp  1683    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00445364  hitchhiker  0.00020178 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0442  hypothetical protein  91.76 
 
 		 1165 bp  1548    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0992939  normal  0.042563 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0629  hypothetical protein  91.76 
 
 		 1165 bp  1548    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  0.528873 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1805  hypothetical protein  94.85 
 
 		 1165 bp  1834    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.074128 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2776    93.83 
 
 		 1167 bp  1737    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2787  hypothetical protein  90.99 
 
 		 1165 bp  1477    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.752338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2942    94.09 
 
 		 1167 bp  1760    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3066    94.34 
 
 		 1167 bp  1784    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13129  decreased coverage  0.000989669 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3487  hypothetical protein  91.93 
 
 		 1165 bp  1564    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3880  hypothetical protein  91.85 
 
 		 1165 bp  1556    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4496    100 
 
 		 1165 bp  2309    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000529627 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1194  hypothetical protein  82.08 
 
 		 261 bp  60  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0655274  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>