13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3066 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0126  hypothetical protein  91.52 
 
 		 1165 bp  1522    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0372  hypothetical protein  93.66 
 
 		 1165 bp  1721    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00445364  hitchhiker  0.00020178 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0442  hypothetical protein  91.86 
 
 		 1165 bp  1554    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0992939  normal  0.042563 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0629  hypothetical protein  91.95 
 
 		 1165 bp  1562    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  0.528873 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1805  hypothetical protein  94.17 
 
 		 1165 bp  1768    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.074128 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2776    94.94 
 
 		 1167 bp  1846    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2787  hypothetical protein  90.92 
 
 		 1165 bp  1467    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.752338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2942    94.34 
 
 		 1167 bp  1790    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3066    100 
 
 		 1167 bp  2313    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13129  decreased coverage  0.000989669 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3487  hypothetical protein  92.2 
 
 		 1165 bp  1586    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3880  hypothetical protein  91.95 
 
 		 1165 bp  1562    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4496    94.34 
 
 		 1165 bp  1784    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000529627 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1194  hypothetical protein  83.02 
 
 		 261 bp  67.9  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0655274  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>