14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1600 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1600  CopG/DNA-binding domain-containing protein  100 
 
 		 189 aa  384  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3444  CopG/DNA-binding domain-containing protein  64.86 
 
 		 187 aa  237  8e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.430101  normal  0.0328627 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2379  CopG domain protein DNA-binding domain protein  53.7 
 
 		 70 aa  60.1  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.952945  normal  0.033656 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4080  hypothetical protein  57.78 
 
 		 87 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4544  hypothetical protein  57.78 
 
 		 87 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17605  normal  0.0941928 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4007  helix-turn-helix protein, CopG  59.09 
 
 		 57 aa  52.8  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00925339  normal  0.282406 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1134  helix-turn-helix protein, CopG  59.09 
 
 		 58 aa  52.4  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0919916  normal  0.382348 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3681  helix-turn-helix protein, CopG  56.82 
 
 		 58 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442121  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4686  helix-turn-helix protein, CopG  56.82 
 
 		 58 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.162122 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5614  hypothetical protein  56.82 
 
 		 58 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3083  glyoxalase family protein  32.2 
 
 		 144 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3720  bleomycin resistance protein  25.19 
 
 		 126 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0087  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.04 
 
 		 123 aa  42  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6216  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.08 
 
 		 149 aa  41.6  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.304536 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>