21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3444 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3444  CopG/DNA-binding domain-containing protein  100 
 
 		 187 aa  376  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.430101  normal  0.0328627 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1600  CopG/DNA-binding domain-containing protein  65.41 
 
 		 189 aa  248  4e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2379  CopG domain protein DNA-binding domain protein  53.7 
 
 		 70 aa  59.7  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.952945  normal  0.033656 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4544  hypothetical protein  57.41 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17605  normal  0.0941928 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4007  helix-turn-helix protein, CopG  60 
 
 		 57 aa  57  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00925339  normal  0.282406 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4080  hypothetical protein  62.5 
 
 		 87 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1134  helix-turn-helix protein, CopG  60.42 
 
 		 58 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0919916  normal  0.382348 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5614  hypothetical protein  53.57 
 
 		 58 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4686  helix-turn-helix protein, CopG  53.57 
 
 		 58 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.162122 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3681  helix-turn-helix protein, CopG  53.57 
 
 		 58 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442121  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5025  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.13 
 
 		 127 aa  45.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2721  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.36 
 
 		 131 aa  45.4  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1544  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.03 
 
 		 131 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0087  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.41 
 
 		 123 aa  45.4  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1574  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.03 
 
 		 131 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.166496  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2679  hypothetical protein  26.92 
 
 		 123 aa  44.7  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1540  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.03 
 
 		 131 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.823568  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2621  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.51 
 
 		 131 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000365872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2554  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.51 
 
 		 131 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000223181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2806  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.03 
 
 		 131 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.981358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4299  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.05 
 
 		 124 aa  41.2  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.171024 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>