42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0941 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0941  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  204  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0975  transmembrane protein  89.22 
 
 		 102 aa  186  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.638779  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2200  putative transmembrane protein  72.73 
 
 		 104 aa  153  8e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.770192  normal  0.375361 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1877  hypothetical protein  72 
 
 		 104 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.470753 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2048  hypothetical protein  66 
 
 		 102 aa  138  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.71029  normal  0.108913 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3200  hypothetical protein  65.98 
 
 		 98 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000623055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1357  hypothetical protein  65.98 
 
 		 98 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0207197  normal  0.0129087 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1995  hypothetical protein  61.86 
 
 		 98 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0084371  normal  0.265781 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5563  hypothetical protein  61.86 
 
 		 98 aa  121  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.526565 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2259  hypothetical protein  61.86 
 
 		 98 aa  120  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1623  hypothetical protein  61.86 
 
 		 98 aa  120  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.4029  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2235  hypothetical protein  61.86 
 
 		 98 aa  120  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2152  hypothetical protein  60.82 
 
 		 98 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.077172  normal  0.381774 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2273  hypothetical protein  60.82 
 
 		 98 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1075  hypothetical protein  61 
 
 		 101 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1042  hypothetical protein  60.82 
 
 		 98 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271296  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1450  hypothetical protein  58 
 
 		 101 aa  107  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1313  hypothetical protein  58 
 
 		 101 aa  107  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1815  hypothetical protein  58 
 
 		 101 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.975576  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0427  hypothetical protein  58 
 
 		 101 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0723  hypothetical protein  58 
 
 		 101 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.909976  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1144  hypothetical protein  58 
 
 		 101 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.282912  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1304  hypothetical protein  57 
 
 		 101 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.858787  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3496  putative transmembrane protein  53 
 
 		 102 aa  96.3  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862184  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1438  putative transmembrane protein  52.48 
 
 		 100 aa  94.7  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3242  putative transmembrane protein  53.47 
 
 		 100 aa  91.3  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0123666  normal  0.915423 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5166  putative transmembrane protein  44 
 
 		 101 aa  87.8  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.529581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0886  putative transmembrane protein  40.59 
 
 		 107 aa  86.3  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0971  putative transmembrane protein  40.59 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.4311  normal  0.603303 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4071  putative transmembrane protein  44 
 
 		 101 aa  80.1  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.836912 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1277  putative transmembrane protein  43 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.134554  normal  0.169481 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1417  putative transmembrane protein  47.47 
 
 		 102 aa  75.1  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112544  normal  0.0152775 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1156  hypothetical protein  41.57 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0429008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1950  hypothetical protein  43.48 
 
 		 107 aa  72  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1000  hypothetical protein  40 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1756  hypothetical protein  43.56 
 
 		 110 aa  70.1  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.240273  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1956  hypothetical protein  37.62 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0401346 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0831  hypothetical protein  37 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2047  hypothetical protein  46.75 
 
 		 97 aa  67  0.00000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2719  hypothetical protein  42.7 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000307641 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3120  hypothetical protein  42.7 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.375888  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0722  hypothetical protein  34.04 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.334126  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>