42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1417 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1417  putative transmembrane protein  100 
 
 		 102 aa  201  4e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112544  normal  0.0152775 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1277  putative transmembrane protein  56.57 
 
 		 106 aa  102  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.134554  normal  0.169481 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2200  putative transmembrane protein  50 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.770192  normal  0.375361 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0975  transmembrane protein  51.52 
 
 		 102 aa  101  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.638779  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0886  putative transmembrane protein  56.57 
 
 		 107 aa  101  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0971  putative transmembrane protein  56.57 
 
 		 107 aa  101  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.4311  normal  0.603303 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1877  hypothetical protein  48.48 
 
 		 104 aa  98.2  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.470753 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2048  hypothetical protein  48.48 
 
 		 102 aa  96.3  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.71029  normal  0.108913 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0941  hypothetical protein  47.47 
 
 		 102 aa  95.5  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5166  putative transmembrane protein  53.12 
 
 		 101 aa  93.6  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.529581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4071  putative transmembrane protein  54 
 
 		 101 aa  94  7e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.836912 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1995  hypothetical protein  50 
 
 		 98 aa  89.4  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0084371  normal  0.265781 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1357  hypothetical protein  48.96 
 
 		 98 aa  88.6  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0207197  normal  0.0129087 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3200  hypothetical protein  48.96 
 
 		 98 aa  87.4  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000623055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5563  hypothetical protein  50.52 
 
 		 98 aa  87.8  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.526565 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3496  putative transmembrane protein  53.92 
 
 		 102 aa  87.4  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862184  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1075  hypothetical protein  48.48 
 
 		 101 aa  86.7  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1623  hypothetical protein  48.96 
 
 		 98 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.4029  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2235  hypothetical protein  48.96 
 
 		 98 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2259  hypothetical protein  48.96 
 
 		 98 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2273  hypothetical protein  47.92 
 
 		 98 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1042  hypothetical protein  48.96 
 
 		 98 aa  85.5  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271296  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2152  hypothetical protein  46.88 
 
 		 98 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.077172  normal  0.381774 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1438  putative transmembrane protein  53.66 
 
 		 100 aa  82.8  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1756  hypothetical protein  47.52 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.240273  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1156  hypothetical protein  48.84 
 
 		 100 aa  79.7  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0429008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3242  putative transmembrane protein  55.7 
 
 		 100 aa  78.6  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0123666  normal  0.915423 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3120  hypothetical protein  45.83 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.375888  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2047  hypothetical protein  50.62 
 
 		 97 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2719  hypothetical protein  45.83 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000307641 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1000  hypothetical protein  42.57 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1313  hypothetical protein  47.47 
 
 		 101 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1450  hypothetical protein  47.47 
 
 		 101 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1815  hypothetical protein  47.47 
 
 		 101 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.975576  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0427  hypothetical protein  47.47 
 
 		 101 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0723  hypothetical protein  47.47 
 
 		 101 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.909976  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1144  hypothetical protein  47.47 
 
 		 101 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.282912  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1304  hypothetical protein  46.46 
 
 		 101 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.858787  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0722  hypothetical protein  44.21 
 
 		 114 aa  72.4  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.334126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1950  hypothetical protein  44.58 
 
 		 107 aa  67  0.00000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1956  hypothetical protein  40.95 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0401346 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0831  hypothetical protein  37.76 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>