42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A0723 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA1815  hypothetical protein  100 
 
 
101 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.975576  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0723  hypothetical protein  100 
 
 
101 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.909976  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0427  hypothetical protein  100 
 
 
101 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1144  hypothetical protein  100 
 
 
101 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.282912  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1313  hypothetical protein  99.01 
 
 
101 aa  197  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1450  hypothetical protein  99.01 
 
 
101 aa  197  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1304  hypothetical protein  99.01 
 
 
101 aa  196  7e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.858787  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1075  hypothetical protein  93.07 
 
 
101 aa  189  8e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1042  hypothetical protein  90.1 
 
 
98 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271296  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3200  hypothetical protein  87.13 
 
 
98 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000623055  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1623  hypothetical protein  86.14 
 
 
98 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.4029  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1995  hypothetical protein  86.14 
 
 
98 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0084371  normal  0.265781 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2235  hypothetical protein  86.14 
 
 
98 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2259  hypothetical protein  86.14 
 
 
98 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5563  hypothetical protein  86.14 
 
 
98 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.526565 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2273  hypothetical protein  85.15 
 
 
98 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2152  hypothetical protein  84.16 
 
 
98 aa  170  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.077172  normal  0.381774 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1357  hypothetical protein  85.15 
 
 
98 aa  169  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0207197  normal  0.0129087 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0975  transmembrane protein  58 
 
 
102 aa  116  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.638779  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0941  hypothetical protein  59 
 
 
102 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120783  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1877  hypothetical protein  54 
 
 
104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.470753 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2200  putative transmembrane protein  54.55 
 
 
104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.770192  normal  0.375361 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2048  hypothetical protein  52 
 
 
102 aa  103  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.71029  normal  0.108913 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1438  putative transmembrane protein  56.98 
 
 
100 aa  99  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3496  putative transmembrane protein  53 
 
 
102 aa  94.7  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862184  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1277  putative transmembrane protein  48 
 
 
106 aa  91.7  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.134554  normal  0.169481 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0886  putative transmembrane protein  45.63 
 
 
107 aa  89.4  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4071  putative transmembrane protein  46.53 
 
 
101 aa  89.7  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.836912 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5166  putative transmembrane protein  45 
 
 
101 aa  89  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.529581  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0971  putative transmembrane protein  44.66 
 
 
107 aa  87.8  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.4311  normal  0.603303 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3242  putative transmembrane protein  53.01 
 
 
100 aa  87  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0123666  normal  0.915423 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1156  hypothetical protein  45.56 
 
 
100 aa  78.2  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0429008  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1756  hypothetical protein  45.36 
 
 
110 aa  75.9  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.240273  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0722  hypothetical protein  44.33 
 
 
114 aa  73.9  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.334126  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1950  hypothetical protein  38.38 
 
 
107 aa  72  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1000  hypothetical protein  41.67 
 
 
107 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2047  hypothetical protein  45.78 
 
 
97 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0831  hypothetical protein  36.63 
 
 
111 aa  70.1  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1417  putative transmembrane protein  48.81 
 
 
102 aa  69.3  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112544  normal  0.0152775 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1956  hypothetical protein  39.78 
 
 
119 aa  67  0.00000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0401346 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2719  hypothetical protein  35.35 
 
 
104 aa  61.6  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000307641 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3120  hypothetical protein  35.35 
 
 
104 aa  61.6  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.375888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>