53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2665 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2665  protein of unknown function DUF897  100 
 
 		 319 aa  620  1e-176  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1132  hypothetical protein  66.98 
 
 		 322 aa  409  1e-113  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.123306  normal  0.479537 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3263  hypothetical protein  62.89 
 
 		 322 aa  375  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.789236 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1405  protein of unknown function DUF897  62.19 
 
 		 324 aa  375  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3694  protein of unknown function DUF897  61.86 
 
 		 335 aa  365  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1985  hypothetical protein  64.47 
 
 		 322 aa  356  3.9999999999999996e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.811604  normal  0.124455 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1292  protein of unknown function DUF897  61.22 
 
 		 320 aa  331  9e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.209993  normal  0.286944 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0570  hypothetical protein  49.85 
 
 		 335 aa  279  6e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000587846  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0845  protein of unknown function DUF897  49.68 
 
 		 315 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.106214  normal  0.641047 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4477  hypothetical protein  50.32 
 
 		 313 aa  263  3e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2163  hypothetical protein  44 
 
 		 325 aa  260  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.386574 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3830  hypothetical protein  49.54 
 
 		 324 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.30842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0109  hypothetical protein  47.53 
 
 		 326 aa  259  4e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.520221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2950  hypothetical protein  44.73 
 
 		 322 aa  258  8e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1247  hypothetical protein  47.19 
 
 		 310 aa  258  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.252971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02331  putative sodium-dependent bicarbonate transporter  43.65 
 
 		 331 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07971  putative sodium-dependent bicarbonate transporter  43.79 
 
 		 341 aa  248  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0485  hypothetical protein  37.94 
 
 		 359 aa  247  2e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1580  permease  42.41 
 
 		 330 aa  247  2e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02901  putative sodium-dependent bicarbonate transporter  41.8 
 
 		 330 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.28305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2730  permease  43.89 
 
 		 327 aa  241  2e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.36394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02311  putative sodium-dependent bicarbonate transporter  41.8 
 
 		 332 aa  239  6.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02331  putative sodium-dependent bicarbonate transporter  41.8 
 
 		 332 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.736021  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0215  putative sodium-dependent bicarbonate transporter  40.8 
 
 		 332 aa  237  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1969  hypothetical protein  43.81 
 
 		 334 aa  235  9e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000472474  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02421  putative sodium-dependent bicarbonate transporter  40.87 
 
 		 332 aa  233  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.163448  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3237  protein of unknown function DUF897  47.47 
 
 		 324 aa  221  9e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0139  hypothetical protein  43.61 
 
 		 320 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.618095  normal  0.96183 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0635  protein of unknown function DUF897  48.37 
 
 		 313 aa  218  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4061  hypothetical protein  47.99 
 
 		 320 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0773794  normal  0.300283 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2056  hypothetical protein  40.44 
 
 		 319 aa  209  4e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1267  hypothetical protein  38.17 
 
 		 320 aa  206  4e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.399434 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3084  hypothetical protein  42.38 
 
 		 319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1619  protein of unknown function DUF897  36.89 
 
 		 355 aa  193  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2255  hypothetical protein  37.46 
 
 		 355 aa  187  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.301479  normal  0.773534 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0692  hypothetical protein  41.97 
 
 		 313 aa  178  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0865  hypothetical protein  44.41 
 
 		 319 aa  168  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0919  protein of unknown function DUF897  44.04 
 
 		 319 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3259  hypothetical protein  39.67 
 
 		 317 aa  166  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0929  hypothetical protein  43.71 
 
 		 319 aa  165  8e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.412848 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3443  hypothetical protein  43.71 
 
 		 319 aa  165  9e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0834  hypothetical protein  43.71 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3107  hypothetical protein  43.38 
 
 		 319 aa  164  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3758  hypothetical protein  43.75 
 
 		 319 aa  160  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0895  hypothetical protein  44.04 
 
 		 319 aa  159  8e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0703  hypothetical protein  39.74 
 
 		 316 aa  155  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.463597  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12412  hypothetical protein  43.45 
 
 		 417 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.628443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1475  sodium-dependent bicarbonate transporter  28.22 
 
 		 373 aa  126  6e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.713474  normal  0.327214 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1268  protein of unknown function DUF897  28.06 
 
 		 375 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.843012 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5063  protein of unknown function DUF897  26.9 
 
 		 377 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1249  protein of unknown function DUF897  28.18 
 
 		 366 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1280  protein of unknown function DUF897  28.18 
 
 		 366 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0821415 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3027  hypothetical protein  26.92 
 
 		 369 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.98769  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>