53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_02331 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_02331  putative sodium-dependent bicarbonate transporter  100 
 
 
331 aa  644    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02311  putative sodium-dependent bicarbonate transporter  78.66 
 
 
332 aa  514  1e-144  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02331  putative sodium-dependent bicarbonate transporter  78.35 
 
 
332 aa  511  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.736021  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1580  permease  76.97 
 
 
330 aa  508  1e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0215  putative sodium-dependent bicarbonate transporter  77.74 
 
 
332 aa  507  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02901  putative sodium-dependent bicarbonate transporter  76.06 
 
 
330 aa  506  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.28305  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02421  putative sodium-dependent bicarbonate transporter  77.13 
 
 
332 aa  504  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.163448  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07971  putative sodium-dependent bicarbonate transporter  68.28 
 
 
341 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2950  hypothetical protein  61.11 
 
 
322 aa  379  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2163  hypothetical protein  58.72 
 
 
325 aa  373  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.386574 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2730  permease  49.39 
 
 
327 aa  328  6e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.36394  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0139  hypothetical protein  47.2 
 
 
320 aa  271  9e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.618095  normal  0.96183 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1619  protein of unknown function DUF897  42.82 
 
 
355 aa  263  3e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2665  protein of unknown function DUF897  43.65 
 
 
319 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3830  hypothetical protein  43.29 
 
 
324 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.30842  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2255  hypothetical protein  42.74 
 
 
355 aa  247  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.301479  normal  0.773534 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0109  hypothetical protein  44.65 
 
 
326 aa  238  1e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.520221  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3263  hypothetical protein  44.04 
 
 
322 aa  238  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.789236 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1267  hypothetical protein  43.12 
 
 
320 aa  236  3e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.399434 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2056  hypothetical protein  42.95 
 
 
319 aa  231  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0485  hypothetical protein  38.28 
 
 
359 aa  230  3e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1405  protein of unknown function DUF897  41.8 
 
 
324 aa  228  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1132  hypothetical protein  39.82 
 
 
322 aa  225  6e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.123306  normal  0.479537 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1985  hypothetical protein  44.62 
 
 
322 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.811604  normal  0.124455 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1247  hypothetical protein  41.69 
 
 
310 aa  216  5e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.252971  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4061  hypothetical protein  44.07 
 
 
320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0773794  normal  0.300283 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0845  protein of unknown function DUF897  41.96 
 
 
315 aa  209  8e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.106214  normal  0.641047 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1969  hypothetical protein  37.99 
 
 
334 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000472474  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3237  protein of unknown function DUF897  41.99 
 
 
324 aa  199  5e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1292  protein of unknown function DUF897  40.57 
 
 
320 aa  198  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.209993  normal  0.286944 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4477  hypothetical protein  40.88 
 
 
313 aa  194  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3694  protein of unknown function DUF897  37.8 
 
 
335 aa  194  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0570  hypothetical protein  37.06 
 
 
335 aa  183  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000587846  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0635  protein of unknown function DUF897  41.45 
 
 
313 aa  182  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3084  hypothetical protein  36.94 
 
 
319 aa  161  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3758  hypothetical protein  38.17 
 
 
319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0692  hypothetical protein  35.03 
 
 
313 aa  137  4e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0865  hypothetical protein  37.3 
 
 
319 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3259  hypothetical protein  33.23 
 
 
317 aa  130  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3107  hypothetical protein  36.91 
 
 
319 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0834  hypothetical protein  37.26 
 
 
319 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3443  hypothetical protein  35.96 
 
 
319 aa  125  9e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0919  protein of unknown function DUF897  35.96 
 
 
319 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0929  hypothetical protein  35.96 
 
 
319 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.412848 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0703  hypothetical protein  34.91 
 
 
316 aa  123  5e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.463597  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12412  hypothetical protein  39.43 
 
 
417 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.628443  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0895  hypothetical protein  34.07 
 
 
319 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1475  sodium-dependent bicarbonate transporter  23.01 
 
 
373 aa  98.2  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.713474  normal  0.327214 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1268  protein of unknown function DUF897  23.63 
 
 
375 aa  95.9  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.843012 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5063  protein of unknown function DUF897  22.55 
 
 
377 aa  92.8  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1249  protein of unknown function DUF897  23.33 
 
 
366 aa  92.8  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1280  protein of unknown function DUF897  23.33 
 
 
366 aa  92.8  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0821415 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3027  hypothetical protein  21.63 
 
 
369 aa  77  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.98769  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>