52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3027 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3027  hypothetical protein  100 
 
 		 369 aa  739    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.98769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1280  protein of unknown function DUF897  88.98 
 
 		 366 aa  636    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0821415 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5063  protein of unknown function DUF897  82.98 
 
 		 377 aa  634    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1249  protein of unknown function DUF897  88.98 
 
 		 366 aa  636    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1475  sodium-dependent bicarbonate transporter  80.27 
 
 		 373 aa  588  1e-167  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.713474  normal  0.327214 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1268  protein of unknown function DUF897  72.19 
 
 		 375 aa  507  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.843012 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0485  hypothetical protein  27.45 
 
 		 359 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3263  hypothetical protein  28.69 
 
 		 322 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.789236 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1132  hypothetical protein  28.81 
 
 		 322 aa  119  9e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.123306  normal  0.479537 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1969  hypothetical protein  28.13 
 
 		 334 aa  117  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000472474  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2056  hypothetical protein  27.04 
 
 		 319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0139  hypothetical protein  29.23 
 
 		 320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.618095  normal  0.96183 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2665  protein of unknown function DUF897  27.55 
 
 		 319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1985  hypothetical protein  28.69 
 
 		 322 aa  111  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.811604  normal  0.124455 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1619  protein of unknown function DUF897  26.93 
 
 		 355 aa  108  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1405  protein of unknown function DUF897  29.36 
 
 		 324 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2255  hypothetical protein  27.35 
 
 		 355 aa  105  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.301479  normal  0.773534 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0570  hypothetical protein  26.87 
 
 		 335 aa  103  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000587846  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3694  protein of unknown function DUF897  25 
 
 		 335 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2950  hypothetical protein  23.3 
 
 		 322 aa  99.8  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1580  permease  23.76 
 
 		 330 aa  99  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1292  protein of unknown function DUF897  25.14 
 
 		 320 aa  97.8  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.209993  normal  0.286944 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02901  putative sodium-dependent bicarbonate transporter  23.76 
 
 		 330 aa  97.4  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.28305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02421  putative sodium-dependent bicarbonate transporter  24.52 
 
 		 332 aa  97.1  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.163448  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0215  putative sodium-dependent bicarbonate transporter  24.3 
 
 		 332 aa  95.9  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02331  putative sodium-dependent bicarbonate transporter  24.3 
 
 		 332 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.736021  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02311  putative sodium-dependent bicarbonate transporter  24.3 
 
 		 332 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07971  putative sodium-dependent bicarbonate transporter  22.65 
 
 		 341 aa  92.8  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2730  permease  23.58 
 
 		 327 aa  91.7  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.36394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0845  protein of unknown function DUF897  26.14 
 
 		 315 aa  90.9  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.106214  normal  0.641047 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2163  hypothetical protein  22.22 
 
 		 325 aa  89.7  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.386574 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1247  hypothetical protein  26.53 
 
 		 310 aa  89  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.252971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12412  hypothetical protein  24.51 
 
 		 417 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.628443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02331  putative sodium-dependent bicarbonate transporter  21.63 
 
 		 331 aa  84.3  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3830  hypothetical protein  24.65 
 
 		 324 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.30842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0109  hypothetical protein  24.65 
 
 		 326 aa  81.3  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.520221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3237  protein of unknown function DUF897  26.63 
 
 		 324 aa  76.3  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4477  hypothetical protein  23.36 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3084  hypothetical protein  22.54 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1267  hypothetical protein  21.26 
 
 		 320 aa  67  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.399434 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3107  hypothetical protein  23.55 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0834  hypothetical protein  23.26 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0929  hypothetical protein  23.77 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.412848 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3443  hypothetical protein  23.48 
 
 		 319 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0919  protein of unknown function DUF897  22.97 
 
 		 319 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3758  hypothetical protein  22.09 
 
 		 319 aa  54.3  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4061  hypothetical protein  23.81 
 
 		 320 aa  53.5  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0773794  normal  0.300283 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0895  hypothetical protein  22.51 
 
 		 319 aa  53.1  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0865  hypothetical protein  22.67 
 
 		 319 aa  53.1  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0635  protein of unknown function DUF897  24.85 
 
 		 313 aa  53.1  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0692  hypothetical protein  22.25 
 
 		 313 aa  51.2  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3259  hypothetical protein  23.32 
 
 		 317 aa  47  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>