29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3139 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3139  glycosyl transferase family 8  100 
 
 
303 aa  636    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29327  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3410  glycosyl transferase family 8  92.41 
 
 
303 aa  596  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1098  glycosyl transferase family protein  28.42 
 
 
278 aa  73.2  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0504909  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2994  glycosyl transferase family 8  30.53 
 
 
300 aa  68.9  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.162818  normal  0.206335 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2733  glycosyl transferase family 8  31.55 
 
 
301 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.265669  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1382  glycosyl transferase family protein  26.61 
 
 
316 aa  58.9  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3683  glycosyl transferase family protein  25.11 
 
 
334 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0415394  normal  0.880044 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5876  glycosyl transferase family 8  26.23 
 
 
328 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00913304  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2558  glycosyl transferase family protein  25.27 
 
 
331 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5779  glycosyl transferase family 8  23.45 
 
 
347 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149079 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2963  glycosyl transferase family protein  29.67 
 
 
319 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0383599 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0950  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  26.74 
 
 
274 aa  54.7  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0705  glycosyl transferase family 8  25.47 
 
 
347 aa  53.9  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000314752  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2255  glycosyl transferase family 8  25.57 
 
 
283 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0672322 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0704  glycosyl transferase family 8  24.65 
 
 
331 aa  51.2  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000224419  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0702  glycosyl transferase family 8  26.11 
 
 
334 aa  49.7  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000654129  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2193  glycosyl transferase family 8  25.11 
 
 
283 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0059  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  22.99 
 
 
317 aa  48.5  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00101  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0700  glycosyl transferase family 8  24.24 
 
 
336 aa  48.1  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000278509  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0634  glycosyl transferase family 8  23.9 
 
 
315 aa  48.1  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.469103 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2061  glycosyl transferase family protein  25.43 
 
 
401 aa  47.8  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2101  glycosyl transferase family 8  28 
 
 
242 aa  46.2  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.924704  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44760  Lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  29.59 
 
 
326 aa  46.2  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3427  lipopolysaccharide 1  28.19 
 
 
342 aa  44.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4127  lipopolysaccharide 1,2-galactosyltransferase  24.6 
 
 
341 aa  43.9  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76484  glycogenin glucosyltransferase  28.64 
 
 
411 aa  43.9  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0167  glycosyl transferase family protein  23.66 
 
 
318 aa  42.7  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.512508 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1009  glycosyl transferase family 8  24.58 
 
 
305 aa  42.7  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.219691  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1515  hypothetical protein  23.66 
 
 
318 aa  42.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>