23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2911 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2911  protein of unknown function DUF1238  100 
 
 
331 aa  671    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.503253  normal  0.996874 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3172  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  94.56 
 
 
331 aa  646    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.875314 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4476  hypothetical protein  74.92 
 
 
331 aa  523  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0841  hypothetical protein  62.84 
 
 
323 aa  414  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00302615  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3907  hypothetical protein  61.93 
 
 
321 aa  406  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.145402  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4107  hypothetical protein  60.48 
 
 
326 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000282809 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1419  hypothetical protein  61.63 
 
 
334 aa  392  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0884  hypothetical protein  59.52 
 
 
330 aa  389  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0942  hypothetical protein  59.21 
 
 
330 aa  387  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.170277  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1023  hypothetical protein  58.21 
 
 
335 aa  380  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.198151  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4247  hypothetical protein  62.54 
 
 
327 aa  377  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.396011 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3615  hypothetical protein  59.39 
 
 
336 aa  373  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1329  hypothetical protein  61.09 
 
 
326 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.430778  normal  0.0298826 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3225  hypothetical protein  56.96 
 
 
330 aa  366  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.391931  normal  0.889807 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1997  hypothetical protein  56.52 
 
 
329 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.168934  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1710  hypothetical protein  54.72 
 
 
330 aa  358  5e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.262072  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3770  hypothetical protein  54.72 
 
 
330 aa  358  7e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.211891  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49280  hypothetical protein  55.86 
 
 
331 aa  354  1e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2665  hypothetical protein  55.99 
 
 
332 aa  353  2.9999999999999997e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0513087  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36060  hypothetical protein  53.48 
 
 
331 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00617282  hitchhiker  0.00000000716274 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3073  hypothetical protein  53.46 
 
 
334 aa  328  8e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.521194  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0552  hypothetical protein  25.56 
 
 
297 aa  56.6  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44526  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2320  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  26.56 
 
 
291 aa  44.3  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>