30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4107 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4107  hypothetical protein  100 
 
 
326 aa  669    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000282809 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0841  hypothetical protein  66.36 
 
 
323 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00302615  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3907  hypothetical protein  65.54 
 
 
321 aa  442  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.145402  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4476  hypothetical protein  60.54 
 
 
331 aa  402  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3172  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  61.08 
 
 
331 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.875314 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2911  protein of unknown function DUF1238  60.48 
 
 
331 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.503253  normal  0.996874 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4247  hypothetical protein  60.12 
 
 
327 aa  361  8e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.396011 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0884  hypothetical protein  55.45 
 
 
330 aa  361  1e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1419  hypothetical protein  56.06 
 
 
334 aa  360  2e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49280  hypothetical protein  57.23 
 
 
331 aa  360  2e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0942  hypothetical protein  55.15 
 
 
330 aa  358  7e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.170277  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3770  hypothetical protein  57.47 
 
 
330 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.211891  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1997  hypothetical protein  56.83 
 
 
329 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.168934  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1023  hypothetical protein  57.89 
 
 
335 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.198151  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3615  hypothetical protein  60.42 
 
 
336 aa  351  8.999999999999999e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1710  hypothetical protein  56.17 
 
 
330 aa  350  1e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.262072  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3225  hypothetical protein  55.7 
 
 
330 aa  347  1e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.391931  normal  0.889807 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2665  hypothetical protein  60.07 
 
 
332 aa  342  4e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0513087  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36060  hypothetical protein  53.7 
 
 
331 aa  340  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00617282  hitchhiker  0.00000000716274 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3073  hypothetical protein  53.63 
 
 
334 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.521194  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1329  hypothetical protein  58.97 
 
 
326 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.430778  normal  0.0298826 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0552  hypothetical protein  28.65 
 
 
297 aa  67.4  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44526  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0860  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  27.32 
 
 
294 aa  48.5  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2243  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  29.53 
 
 
299 aa  47.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0481778  normal  0.293361 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2320  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  31 
 
 
291 aa  45.8  0.0009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1198  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  31.07 
 
 
278 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0259  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  24.67 
 
 
293 aa  45.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000269221 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0314  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  26.51 
 
 
281 aa  43.5  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3458  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  28.66 
 
 
331 aa  42.7  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4483  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  27.47 
 
 
288 aa  42.7  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0909663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>