31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1023 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1023  hypothetical protein  100 
 
 
335 aa  686    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.198151  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3770  hypothetical protein  59.63 
 
 
330 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.211891  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2911  protein of unknown function DUF1238  58.21 
 
 
331 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.503253  normal  0.996874 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4476  hypothetical protein  59.32 
 
 
331 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1710  hypothetical protein  57.41 
 
 
330 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.262072  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3225  hypothetical protein  57.88 
 
 
330 aa  376  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.391931  normal  0.889807 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3172  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  57.94 
 
 
331 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.875314 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1997  hypothetical protein  57.23 
 
 
329 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.168934  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49280  hypothetical protein  60.99 
 
 
331 aa  368  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2665  hypothetical protein  56.85 
 
 
332 aa  370  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0513087  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1329  hypothetical protein  61.9 
 
 
326 aa  366  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.430778  normal  0.0298826 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3073  hypothetical protein  57.4 
 
 
334 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.521194  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3907  hypothetical protein  58.33 
 
 
321 aa  365  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.145402  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36060  hypothetical protein  57.58 
 
 
331 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00617282  hitchhiker  0.00000000716274 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0884  hypothetical protein  56.12 
 
 
330 aa  363  2e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3615  hypothetical protein  57.14 
 
 
336 aa  362  6e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0841  hypothetical protein  57.72 
 
 
323 aa  360  1e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00302615  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0942  hypothetical protein  55.82 
 
 
330 aa  361  1e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.170277  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1419  hypothetical protein  55.65 
 
 
334 aa  354  1e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4107  hypothetical protein  57.89 
 
 
326 aa  353  2.9999999999999997e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000282809 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4247  hypothetical protein  67.05 
 
 
327 aa  339  2.9999999999999998e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.396011 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0552  hypothetical protein  25.79 
 
 
297 aa  58.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44526  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0545  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  28.24 
 
 
272 aa  54.3  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2320  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  33.04 
 
 
291 aa  52.8  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4483  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  29.71 
 
 
288 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0909663  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2243  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  30.88 
 
 
299 aa  51.2  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0481778  normal  0.293361 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0860  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  32.76 
 
 
294 aa  46.2  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1198  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  32.26 
 
 
278 aa  46.2  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0314  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  29.44 
 
 
281 aa  44.3  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4503  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  28.74 
 
 
290 aa  44.3  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3859  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  27.22 
 
 
278 aa  43.1  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000271699  normal  0.545193 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>