11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_R0036 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_R0036    100 
 
 		 356 bp  706    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129143  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0041    84.36 
 
 		 384 bp  226  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00705432  hitchhiker  0.00312299 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0019    84.23 
 
 		 384 bp  220  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  unclonable  0.0000024281 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0012    82.58 
 
 		 384 bp  190  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.766656  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0042    88.31 
 
 		 376 bp  133  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.133373  normal  0.395304 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0032    93.18 
 
 		 376 bp  127  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.550963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0027    93.18 
 
 		 378 bp  127  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0037    92.22 
 
 		 384 bp  123  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0118004 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0060    92.31 
 
 		 377 bp  117  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709504 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0014    94.74 
 
 		 356 bp  60  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00683811  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0039    94.74 
 
 		 358 bp  60  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000972065  hitchhiker  3.4201500000000003e-23 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>