18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1879 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1879  hypothetical protein  100 
 
 		 52 aa  93.6  8e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3331  hypothetical protein  71.15 
 
 		 52 aa  62  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.449636  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2168  hypothetical protein  66.67 
 
 		 50 aa  58.2  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2127  hypothetical protein  75 
 
 		 52 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.071292  normal  0.529379 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2140  hypothetical protein  75 
 
 		 52 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.635933  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2300  hypothetical protein  56.76 
 
 		 50 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.78628  normal  0.0803488 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2051  hypothetical protein  90.91 
 
 		 52 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5990  hypothetical protein  76.92 
 
 		 52 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4156  hypothetical protein  66 
 
 		 51 aa  43.9  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1487  hypothetical protein  85.71 
 
 		 52 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.464442 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3236  hypothetical protein  73.53 
 
 		 53 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0444  hypothetical protein  83.87 
 
 		 51 aa  41.2  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0060  hypothetical protein  65.38 
 
 		 76 aa  40.8  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.517772 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5076  hypothetical protein  81.25 
 
 		 89 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4341  hypothetical protein  81.25 
 
 		 51 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.833629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3216  hypothetical protein  81.25 
 
 		 51 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.965485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5838  hypothetical protein  81.25 
 
 		 51 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5022  hypothetical protein  81.25 
 
 		 51 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.105589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>